Mannen i 30-årene er ansatt i en barnehage i Bergen kommune.
Politiet mener at det mannen har gjort kvalifiserer til en seksuell handling. Det kommer inn under paragrafen om grov voldtekt av barn under 14 år.
Det fornærmede barnet i saken ble avhørt på Barnehuset i Bergen tirsdag.
– Mistanken mot mannen ble styrket etter avhøret. Han ble deretter pågrepet, sier politiadvokat Eli Andrea Skaar i Vest politidistrikt til NRK.
Mannen ble pågrepet i sitt eget hjem tirsdag. Politiet har ransaket boligen, og beslaglagt datautstyr hos siktede. Politiet har ikke enda rukket å gjennomgå beslaget. Den siktede mannen er avhørt, og erkjenner ikke straffskyld.
Les også: Hytteinteressen stuper
Mannen fremstilles for fengsling i Hordaland tingrett torsdag klokken 10. Politiet vil ikke kommentere overfor NRK om mannen er kjent for dem fra tidligere.
Politiet sier til NRK at de frykter bevisforspillelsesfare, og at de derfor vil be om at mannen fengsles i fire uker med brev,- media- og besøksforbud.
Politiet vil ikke oppgi navnet på barnehagen eller hvor den ligger. Det sier også at det er for tidlig å si om det er flere fornærmede barn i saken.